التشخيص الجزيئي باستخدام تقانة تسلسل الجيل التالي (NGS) لخنفساء الحبوب المنشارية (Oryzaephilus surinamensis) المنتشرة على أنواع مختلفة من الحبوب في محافظة كربلاء، العراق

الملخص

هدفت الدراسة إلى إثراء المعرفة حول آفة خنفساء الحبوب المنشارية المهمة، حيث تم اجراء التشخيص الجزيئي لها والتعرف على نوع البكتيريا المتعايشة داخلها. تضمنت الدراسة تربية حشرة خنفساء الحبوب المنشارية (Oryzaephilus surinamensis L.) والتي تعد من الآفات الحشرية المهمة التي تصيب المواد الغذائية المخزونة وخاصة الحبوب والتمور في العراق وتسبب خسائر اقتصادية كبيرة، وتسجيلها في المركز الدولي لمعلومات التقانة الحيوية الأمريكي. تم تأكيد الهوية الجزيئية لحشرة O. surinamensis المنتشرة في محافظة كربلاء باستخدام تقنية تسلسل الجيل التالي (Next generation sequencing, NGS) وتحديد التشابه من خلال الميتوكزندريا الخاصة بالحشرة (mtCOX). أثبتت نتائج التشخيص الجزيئي باستعمال الواسمين الوراثيين المتمثلة بجين Cytochrome c oxidase subunit I وجين الوحدة الكبيرة (Large ribosomal subunit) أن الحشرة هي خنفساء الحبوب المنشارية المسننة (O. surinamensis) من خلال نسب التشابه العالية > 99 و 92% لهذين الجينين، على التوالي، ومقارنة مع العديد من التسجيلات العالمية لنفس الحشرة. أظهر تحليل القرابة الوراثية لهذين الجينين تقارباً كبيراً مع عزلات عالمية لنفس النوع من خلال تجمعها في نفس الفرع، وتم تحديد أرقام وصول خاصة لهذين الجينين في البنك الجيني وقد تم تسميتها O. surinamensis Karbala-1 isolate وهي PV839593 و PV809953، على التوالي. كما أظهرت النتائج وجود بكتيرياFlavobacteriales  ولأول مرة في العراق من خلال نسبة تشابه بلغت 98.1% مع الجين 16SrRNA المرجعي لنفس البكتيريا. وقد حفظ التسجيل لهذه البكتيريا في البنك الجيني تحت رقم الوصول PV809954.10 كذلك تم التشخيص الجزيئي لبكتيريا متعايشة أخرى وهيWolbachia endosymbiont of O. surinamensis strain Karbala-1 وذلك من خلال تحديد تسلسل جينوم الكروموسوم الكامل لهذه البكتيريا المتعايشة والذي كان يشابة التسلسل المرجعي لكروموسوم نفس البكتيريا وبنسبة 97.5% مع نسبة تغطية بلغت أكتر من 95%. وقد تم توثيق تسلسل هذه البكتيريا في بنك الجينات.

كلمات مفتاحية:

خنفسـاء الحبـوب المنشاريـة،Oryzaephilus surinamensis ، تقنية NGS، بكتيريا Flavobacteriales sp..