حصر وتوصيف جزيئي للإصابة بالفايتوبلازما على محصول الفليفلة المزروعة في حقول محافظة حلب، سورية

الملخص

يعد محصول الفليفلة من الخضار الغذائية المهمة التي تزرع في محافظة حلب. تم إجراء عملية حصر للإصابة بالفايتوبلازما وذلك خلال الموسم الزراعي لعام 2022 في 9 حقول موزعة على مناطق دير حافر والسفيرة وكويرس. جمعت 22 عينة نباتية مصابة ظاهرياً، واستخلص الـ DNA الجينومي منها، وقدّر تركيزه ونقاوته ونوعيته. أجري التفاعل التسلسلي للبوليميراز المتداخل (Nested PCR) على مرحلتين باستخدام البادئات P1/P7 و R16F2n/R16R2 للكشف عن الإصابة بالفايتوبلازما. استخدمت 6 أنزيمات قطع Rsal، HhaI، EcoRI، BamHI، HinfI و  AluIفي تقنية PCR-RFLP لهضم نواتج تفاعل الـ PCR في المرحلة الثانية. تم فصل نواتج الهضم على هلامة أجاروز 2%، وقورنت النتائج مع الدراسات المرجعية لتحديد المجموعات الجزيئية المعتمدة على المورثة 16S للفايتوبلازما. بلغ متوسط نسبة الإصابة بالفايتوبلازما 2% في ديرحافر، 3% في السفيرة و 1% في كويرس. أظهرت نتائج التفاعل التسلسلي للبوليميراز المتداخل أن جميع عينات الفليفلة التي تم جمعها كانت مصابة بالفايتوبلازما بنسبة 100%. أظهرت نتائج القطع الأنزيمي لأربعة من أنزيمات القطع Rsal، HhaI، HinfI و AluI عدم وجود تطابق تام في نماذج القطع بينها وبين المخطط المنقح لتصنيف الفايتوبلازما؛ الأمر الذي يتطلب تحليل التتالي النكليوتيدي للمورثة 16S RNA، وتحليل جميع مواقع القطع فيها لتحديد المجموعات الجزيئية التي تتبع لها العزلات المدروسة.

كلمات مفتاحية:

الفايتوبلازما، الفليفلة، توصيف جزيئي، تقنية PCR-RFLP.